A Bacia de S. Miguel é uma das depressões submarinas que faz parte da estrutura vulcano-tectónica designada Rifte da Terceira. Esta depressão situa-se a sueste de S. Miguel, entre os flancos submarinos daquela ilha e do relevo das Formigas.
A bacia, que apresenta forma rectangular alongada na direcção NW-SE, é limitada a nordeste e a sudoeste por porções de fundo oceânico que se situam geralmente a profundidades entre 1600 e 1800 m. Do lado sudoeste existe um vulcão submarino, o pesqueiro Grande Norte, que se eleva à profundidade de 117 m. O fundo da depressão é limitado pela isóbata dos 2800 m, existindo, portanto, desníveis submarinos que rondam 1000 m.
A Bacia de S. Miguel tem, como as restantes depressões do Rifte da Terceira, origem tectónica, encontrando-se limitada a nordeste e sudoeste por falhas com orientação NW-SE. É possível que os limites noroeste e sueste da bacia estejam igualmente controlados por acidentes tectónicos.
Existe sismicidade instrumental associada a esta estrutura tectónica, indicando claramente o carácter activo das falhas que lhe deram origem. Ver bacias submarinas dos Açores. José Madeira (Abr.1998)